MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 14266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018658	CTT	2	6	8368	8373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018658	CCT	2	6	8376	8381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018658	T	7	7	8429	8435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018658	GTA	2	6	8464	8469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018658	CAA	2	6	8470	8475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018658	TAC	2	6	8486	8491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018658	TCA	2	6	8517	8522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018658	TAC	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018658	ATCG	2	8	8553	8560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018658	AGA	2	6	8572	8577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018658	TCAC	2	8	14390	14397	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018658	TCA	2	6	14400	14405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018658	ATG	2	6	14450	14455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018658	TGA	2	6	16068	16073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018658	CAT	3	9	16101	16109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018658	GGC	2	6	16123	16128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018658	TGC	2	6	16149	16154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018658	A	8	8	16187	16194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018658	ACCTG	2	10	16281	16290	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_018658	GCC	2	6	16763	16768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018658	TACT	2	8	16833	16840	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018658	CTT	2	6	16843	16848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018658	TGG	2	6	17321	17326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018658	T	7	7	17330	17336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018658	CTTA	2	8	17339	17346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018658	CAA	2	6	17349	17354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018658	T	6	6	19876	19881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018658	A	6	6	19929	19934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018658	T	8	8	19939	19946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018658	GTC	2	6	20058	20063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018658	ACG	2	6	23547	23552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018658	ACATAA	2	12	23621	23632	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018658	TGA	2	6	26866	26871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018658	CGG	2	6	26877	26882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018658	ATT	2	6	26885	26890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018658	CCT	2	6	27353	27358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_018658	A	8	8	27407	27414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018658	TGA	2	6	29922	29927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018658	GGGA	2	8	30007	30014	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018658	CT	3	6	30032	30037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018658	ACC	2	6	30059	30064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018658	CTG	2	6	30168	30173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018658	AGA	2	6	30176	30181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018658	TGT	2	6	30414	30419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018658	TTG	2	6	30451	30456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018658	CAC	2	6	30498	30503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_018658	TAAA	2	8	30592	30599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018658	AAC	2	6	33116	33121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018658	T	9	9	33149	33157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018658	TGC	2	6	36679	36684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018658	ATGC	2	8	36696	36703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018658	T	6	6	38164	38169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018658	ATT	3	9	39967	39975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018658	ATT	2	6	39998	40003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018658	GTT	2	6	40054	40059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018658	TCC	2	6	40093	40098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_018658	CGC	2	6	42013	42018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_018658	CA	3	6	42103	42108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018658	AAG	2	6	43356	43361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018658	AGT	2	6	43370	43375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018658	CGTTT	2	10	43833	43842	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018658	T	6	6	43840	43845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018658	TAA	2	6	43884	43889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018658	TATG	2	8	45676	45683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018658	A	6	6	46962	46967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018658	GTATT	2	10	47003	47012	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018658	ATT	2	6	47084	47089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018658	AATT	2	8	47107	47114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018658	TA	3	6	47123	47128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018658	TTGAT	2	10	47179	47188	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018658	AT	3	6	47187	47192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018658	ATT	2	6	47225	47230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018658	T	7	7	47249	47255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018658	AATAG	2	10	47272	47281	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018658	A	6	6	47288	47293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018658	ACA	2	6	47315	47320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018658	AT	3	6	47614	47619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018658	AAAT	2	8	47676	47683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018658	ATTC	2	8	47719	47726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018658	GGT	2	6	49763	49768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018658	AGA	2	6	50573	50578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018658	TC	3	6	51098	51103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018658	TCA	2	6	51646	51651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018658	ATGA	2	8	51680	51687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018658	GGT	2	6	52753	52758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018658	TAA	2	6	52774	52779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018658	ATGAA	2	10	52821	52830	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018658	ATG	2	6	53085	53090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018658	A	6	6	55993	55998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018658	CT	3	6	56083	56088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018658	TG	3	6	56115	56120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018658	ATG	2	6	56135	56140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018658	CGAT	2	8	56184	56191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018658	CGAT	2	8	56197	56204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018658	ATCG	2	8	56214	56221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018658	CAG	2	6	56236	56241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018658	AGG	2	6	56262	56267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018658	A	6	6	57229	57234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018658	ATA	2	6	57279	57284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018658	TCTG	2	8	57285	57292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018658	ATT	2	6	57295	57300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018658	TC	3	6	58188	58193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018658	TCAG	2	8	58196	58203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018658	CTG	2	6	58326	58331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018658	TTA	3	9	58445	58453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018658	ACA	2	6	58500	58505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018658	TTA	2	6	58525	58530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018658	TC	3	6	58608	58613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018658	TTTA	2	8	58641	58648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018658	TCA	2	6	58693	58698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018658	AT	3	6	58843	58848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018658	GACG	2	8	58869	58876	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018658	ATG	2	6	58921	58926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018658	GATA	2	8	59000	59007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018658	ATT	2	6	59045	59050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018658	T	6	6	59067	59072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018658	ACT	2	6	59106	59111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018658	GGT	2	6	59133	59138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018658	A	6	6	59146	59151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018658	ACA	2	6	59178	59183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018658	GCT	2	6	59228	59233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018658	GT	3	6	59252	59257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018658	TTGAT	2	10	59352	59361	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018658	CT	3	6	59452	59457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018658	TTAT	2	8	59668	59675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018658	CCT	2	6	59688	59693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018658	CGC	2	6	59704	59709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_018658	TA	3	6	59712	59717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018658	T	6	6	59721	59726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018658	TCA	3	9	59783	59791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018658	TCA	2	6	60055	60060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018658	ACTCA	2	10	60274	60283	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_018658	CCGT	2	8	60284	60291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018658	CA	3	6	60323	60328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018658	TAC	2	6	60368	60373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018658	GAA	2	6	60395	60400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018658	TTC	2	6	60447	60452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018658	GCA	2	6	60511	60516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018658	CTGC	2	8	60539	60546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018658	TGG	2	6	60618	60623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018658	GCA	2	6	61402	61407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018658	CTG	2	6	61437	61442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018658	TCC	2	6	61683	61688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_018658	TGT	2	6	61692	61697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018658	CAC	2	6	61729	61734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_018658	AAC	2	6	61747	61752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018658	A	6	6	61766	61771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018658	GTT	2	6	61844	61849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_018658	TAC	2	6	118376	118381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_018658	T	7	7	121783	121789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_018658	CTG	2	6	121815	121820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_018658	TGAT	2	8	121881	121888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_018658	TTA	2	6	175941	175946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_018658	A	6	6	179340	179345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_018658	TA	3	6	179357	179362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_018658	TA	3	6	181912	181917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_018658	CGG	2	6	182892	182897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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